More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2382 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2411  putative GntR family regulatory protein  88.65 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0408929  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2460  putative GntR family regulatory protein  88.65 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0419984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2515  putative GntR family regulatory protein  88.65 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249401  normal  0.14976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2619  putative GntR family regulatory protein  88.65 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  normal  0.158643 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  24.06 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.35 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  27.36 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  23.65 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  23.9 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  23.96 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  23.92 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.08 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  26.42 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  24.65 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  26.06 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 260 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 265 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  22.12 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>