More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0496 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  99.53 
 
 
214 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 
219 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
257 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
260 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
230 aa  84.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
230 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  27.13 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4006  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477565  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  28.14 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>