More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3541 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  80.73 
 
 		 218 aa  352  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  57.42 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  38.41 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 275 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  34.64 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.21 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  35.53 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>