More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6702 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  446  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  93.64 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  93.64 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  93.64 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  93.18 
 
 		 220 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  32.16 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  28.02 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  33.1 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  28.5 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  29.9 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>