More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7641 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  473  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 222 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  29.1 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  28.78 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>