More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2899 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  49.55 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  41.38 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  42.23 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 226 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.2 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  28.81 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  29.38 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>