More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3450 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  70.04 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  41.2 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  41.2 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  26.56 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  27.04 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>