More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4416 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  67.59 
 
 
216 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  51.66 
 
 
225 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
216 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 
224 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 
250 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
244 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
233 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 
259 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
241 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  34.93 
 
 
247 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
231 aa  99  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 
204 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
215 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
263 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  36.36 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.07 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.64 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>