More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1795 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  99.57 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 215 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 204 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  42.56 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  32.68 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.11 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  33.87 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  30.89 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>