More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4135 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  92.04 
 
 		 226 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  92.04 
 
 		 226 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  91.59 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  87.61 
 
 		 226 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  87.61 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  87.17 
 
 		 226 aa  327  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  59.82 
 
 		 226 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  46.23 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  46.23 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  48.1 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  41.35 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 250 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3761  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 265 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 255 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.48 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  32.08 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.37 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.19 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  24.26 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>