More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4140 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  56.8 
 
 		 222 aa  240  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  55.61 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  46.19 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  46.19 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  41.83 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  43.15 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 255 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  37.56 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.48 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.03 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.58 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 245 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  33.8 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.27 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 262 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.42 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.97 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.97 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.97 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.97 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.63 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.63 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.82 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  28.77 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.87 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>