More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3108 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  65.18 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  60.71 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  51.69 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  51.69 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  41.06 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  41.63 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  38.1 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.98 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  36.61 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.5 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  41.62 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.13 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.06 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.06 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.06 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.06 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.06 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  36.55 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  30.48 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  29.11 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  29.27 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4649  GntR domain protein  37.01 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>