More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3903 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 235 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  41.2 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  37.67 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.5 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  29.78 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.33 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  31.25 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.01 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.23 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.23 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.23 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.23 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.23 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  30.14 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.13 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  29.63 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.75 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.56 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>