More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1198 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 244 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  46.85 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  46.92 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  37.5 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.76 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.29 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.29 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  36.15 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.54 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  30.09 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.42 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.58 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.58 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.58 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.58 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  30.62 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.62 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  28.33 
 
 		 214 aa  89  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.82 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.13 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  24.24 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  28.44 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  25.59 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>