More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2973 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  51.58 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 235 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  52.91 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  52.91 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  38.65 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.18 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.18 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.18 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.18 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.71 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.87 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.52 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.52 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.8 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  31.96 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.09 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.09 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  32.75 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.31 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  27.44 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.02 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  27.59 
 
 		 214 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  29.56 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3676  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>