More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4203 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  45.66 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.38 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.24 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  36.49 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  34.42 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.98 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.98 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  32.57 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 222 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  28.44 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  26.92 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  26.76 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.96 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>