More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5670 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  80.73 
 
 		 249 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  80.73 
 
 		 249 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  66.81 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  51.17 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  48.42 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  38.79 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  33.68 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.35 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.42 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.94 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.56 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.56 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.56 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.56 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.07 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.12 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.12 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  35.66 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.61 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  28.43 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>