More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3629 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  53.81 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  54.19 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 233 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  39.13 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 262 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  41.76 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 293 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>