More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4720 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  49.76 
 
 		 243 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.08 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.55 
 
 		 240 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  27.55 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.99 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  26.53 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>