More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0649 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  45.37 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  45.97 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  46.27 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  45.77 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  39.9 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  39.81 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  41.31 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  42.79 
 
 		 220 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  41.55 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  42.03 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  42.44 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 216 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 217 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 217 aa  85.5  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>