More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0450 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 232 aa  95.1  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 238 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.16 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.14 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  30.14 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.23 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>