More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3368 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  52.79 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  49.03 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 249 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  37.78 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 262 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  25.69 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 258 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  29.73 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.28 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 255 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 238 aa  84.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32.68 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  33.17 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.2 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>