More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0216 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 290 aa  567  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 233 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 237 aa  90.1  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 233 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 244 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 237 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  86.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 248 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  28.9 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.04 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  28.71 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.77 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  30.68 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  26.53 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>