More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3756 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  99.14 
 
 		 233 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.86 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 312 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 220 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 226 aa  85.5  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  44.23 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  41.41 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.04 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>