More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0483 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
219 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 
227 aa  168  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 
231 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 
233 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
290 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
232 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 
228 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
235 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  35.55 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
230 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
230 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
228 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
234 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
232 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.03 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
229 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
222 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  33.5 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
233 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
242 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
230 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
229 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 
232 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 
223 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
246 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
231 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
222 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
221 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 
238 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 
220 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
230 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
235 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
223 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
227 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 
229 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 
229 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
229 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
251 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
261 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
230 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 
229 aa  104  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 
215 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
250 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 
215 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
226 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  35.05 
 
 
250 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
229 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
250 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
250 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
250 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 
231 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
229 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
234 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
260 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
218 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
224 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
237 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
224 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
239 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
226 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  35.5 
 
 
239 aa  101  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  35.2 
 
 
227 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 
250 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
238 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
237 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
222 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
247 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 
231 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
235 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
256 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>