More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2569 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  70.37 
 
 		 234 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  61.99 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  58.95 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  57.39 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  57.21 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  44.98 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 235 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  29.82 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  30.58 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 223 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  35.2 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>