More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0611 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.48 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.54 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.52 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  43.18 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.55 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>