More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1420 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  72.1 
 
 		 262 aa  339  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  71.81 
 
 		 262 aa  331  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  69.4 
 
 		 240 aa  315  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  64.91 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  58.6 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  54.38 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  53.6 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 312 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  55.3 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  50.9 
 
 		 266 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  52.34 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 265 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.95 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  33.85 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  32.34 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>