More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3241 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 218 aa  352  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  57.42 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.65 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 260 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 256 aa  88.6  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 255 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  33.16 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>