More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2579 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 223 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  44.66 
 
 		 217 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 225 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 223 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 223 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 234 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 223 aa  89.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 220 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 238 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 223 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 233 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 222 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 223 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.57 
 
 		 224 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 242 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 237 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 235 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  30.72 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  30 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  31.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  33.11 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.36 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  26.26 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  27.15 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>