More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1126 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  46.48 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  32.04 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.68 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  29.18 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>