More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1158 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  96.48 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  96.48 
 
 		 250 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  76.55 
 
 		 230 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 230 aa  349  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  74.22 
 
 		 230 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  59.64 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 239 aa  264  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  56.44 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 229 aa  247  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  55.71 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>