More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3619 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  74.06 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  74.06 
 
 		 239 aa  363  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  73.22 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  74.17 
 
 		 240 aa  361  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 239 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  73.8 
 
 		 233 aa  344  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 230 aa  254  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  55.11 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  55.11 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  55.11 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  53.57 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  53.27 
 
 		 243 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>