More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4211 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 220 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  57.42 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  32.91 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>