More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_22960 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31340  transcriptional regulator  43.52 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
226 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  32.98 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  35.87 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
230 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  39.72 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  31.75 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  28.07 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  28.22 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  28.07 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  28.07 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  28.22 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  28.07 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0235  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>