More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0589 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  34.34 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31340  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.49 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.49 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  27.62 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>