More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3595 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  48.95 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  36.53 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 		 263 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 246 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 244 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  46.32 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 274 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 275 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 261 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.18 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 262 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 262 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 262 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  46 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 273 aa  85.1  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 255 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>