More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4366 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
244 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
214 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
227 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 
228 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 
239 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
228 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 
277 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
229 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
261 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.31 
 
 
229 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
244 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
219 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
219 aa  85.5  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  32.52 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
211 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  31.02 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.82 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>