More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1831 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 222 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 290 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.29 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  29.76 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.84 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  29.15 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  29.31 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>