More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3706 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  71.76 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  55.87 
 
 		 221 aa  231  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  54.5 
 
 		 226 aa  225  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  61.43 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  30.45 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.84 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  26.57 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  24.27 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0257  GntR domain protein  33.16 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.28 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>