More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0513 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  97.92 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  76.25 
 
 		 249 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  52.74 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  41.2 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 222 aa  98.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.28 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.49 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.25 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.28 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  26.21 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>