More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1700 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  99.12 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  99.56 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 228 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  86.4 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  86.4 
 
 		 228 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  86.4 
 
 		 228 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  85.96 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  85.96 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  60.44 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 		 228 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  58.82 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  59.73 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  47.11 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  35.24 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.47 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 257 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 284 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  25.91 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>