More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5061 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 236 aa  466  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  61.74 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  58.55 
 
 		 237 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  54.7 
 
 		 241 aa  224  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  54.79 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  35.81 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  36.02 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.32 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 264 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  36.73 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  38.89 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>