More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1938 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  83.33 
 
 
228 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  83.77 
 
 
228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  83.33 
 
 
228 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  86.84 
 
 
228 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  86.4 
 
 
228 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  85.96 
 
 
228 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  85.96 
 
 
228 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  86.4 
 
 
228 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 
228 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 
228 aa  280  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  58.67 
 
 
228 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  59.73 
 
 
228 aa  278  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  58.82 
 
 
228 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  47.81 
 
 
277 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
230 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 
241 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
226 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
248 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
264 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
239 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  35.62 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
224 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
227 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
227 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
240 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 
227 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 
242 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
257 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.85 
 
 
229 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
222 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
241 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
241 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 
234 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
255 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 
231 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
226 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
227 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
237 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
238 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 
239 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
257 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
244 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
225 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
225 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
284 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  27.6 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
265 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 
223 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.57 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  23.86 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>