More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0596 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  41.36 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  33.85 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  38.14 
 
 		 128 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  25.98 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  34.24 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  27.98 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.36 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  28.67 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  28.06 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  27.88 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.11 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.41 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  31.77 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  26.8 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  30.11 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>