More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  67.27 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  53 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 217 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  44.04 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  45.66 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  43.45 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  34.4 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.55 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  32.12 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 262 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  33.73 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 235 aa  88.6  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>