More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_14130 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
229 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12050  transcriptional regulator, GntR family  55 
 
 
253 aa  185  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.549361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  53.4 
 
 
225 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 
219 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
218 aa  168  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  50.24 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
218 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 
232 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
239 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
267 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
290 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
240 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
251 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
216 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
244 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
232 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.2 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  35.9 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
235 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
230 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
232 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 
215 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
242 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.13 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
244 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  35.43 
 
 
237 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 
223 aa  85.1  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>