More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2477 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 214 aa  397  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  57.58 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  52.61 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  51.18 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12050  transcriptional regulator, GntR family  44.69 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.549361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 244 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 264 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  35.23 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.22 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  33.66 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  35.57 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0257  GntR domain protein  41.36 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.8 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  33.01 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>