More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0185 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 222 aa  420  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  51.42 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  43.69 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  44.51 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 256 aa  84.7  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  36.98 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  33.67 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.96 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>