More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3274 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  348  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  58.55 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  44.51 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  37.99 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 217 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 246 aa  87  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 232 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.54 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  39.86 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 256 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7795  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  31.52 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.16 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>